SOBRE O LABORATÓRIO
O grupo do laboratório tem como foco estudar os mecanismos de regulação de RNA humano nos processos fisiológicos e em doenças. Em especial, busca compreender a classe de proteínas de ligação a RNA relacionadas ao câncer e à neurologia.
Em termos mecanísticos, nosso grupo estuda a elucidação de conjuntos de mRNAs ligados por proteínas específicas sob uma determinada condição celular. Também elucidamos os conjuntos de proteínas que participam nestes complexos (interactoma), utilizando modelos celulares. Em paralelo, produzimos as proteínas recombinantes para empregá-las em métodos bioquímicos e em cristalografia para elucidar o mecanismo de atuação das proteínas de ligação à RNA. Além disso, o grupo desenvolve análises de bioinformática para a área de regulação de RNA.
O Laboratório deu origem ao Centro de Química Medicinal da Unicamp (CQMED) do CBMEG, credenciado como Unidade da Empresa Brasileira de Pesquisa e Inovação Industrial do Ministério da Ciência e Tecnologia.
PESQUISADORA RESPONSÁVEL
Dra. Katlin Brauer Massirer
Pesquisadora e Coordenadora
Pesquisadora concursada do CBMEG, UNICAMP desde 2012 e orienta pós-graduandos pelo Programa de Genética e Biologia Molecular do IB, UNICAMP (CAPES 7). Attua conjuntamente na coordenação e condução do Laboratório de Pesquisa Centro de Química Medicinal, o qual é um INCT e a primeira Unidade de Inovação Tecnológica Embrapii na área de Fármacos/Biofármacos desde 2017. O credenciamento como unidade Embrapii proporciona a liderança em vários projetos em parcerias com empresas de Biotecnologia, Laboratórios de Diagnóstico e com a Indústria Farmacêutica Nacional. Em relação a linha de pesquisa, atua na área de proteínas de ligação a RNA em doenças, bioinformática, química medicinal e proteínas recombinantes para diagnóstico. Formação: graduação e mestrado em Farmácia (UFSM, 1996; USP, 2000) e doutorado integral no exterior com dupla ênfase em Genética/Biologia Molecular e Bioinformática (Universidade da Califórnia San Diego, UCSD, 2009). Realizou pós-doutorado colaborativo com Prof Dr Gene Yeo e Prof Dr Alysson Muotri (UCSD, 2009-2011) estudando processos mecanísticos de proteínas de ligação a RNAs relacionados a células tronco e doenças neuronais. Tem 15 anos de experiência em planejamento e execução de projetos de pesquisa e inovação, com publicações internacionais, participação em políticas públicas e divulgação de ciência. Membro suplente da Câmara Interna do Desenvolvimento de Pesquisadores-CIDP, UNICAMP. Tem projetos internacionais com University of Oxford, University of California San Diego, Tubingen University e o Structural Genomics Consortium (SGC) no Canadá.
LINHAS DE PESQUISA
🧑🔬 Proteínas de ligação RNA consideradas como alvos terapêuticos.
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO VINCULADO
- Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecular da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP)
EQUIPE
SERVIÇOS
Teste de reagentes para experimentos de diagnóstico molecular
• Produção de proteínas recombinantes em sistemas eucariotos e procariotos:
• Teste de atividade de proteínas recombinantes
• Ensaio bioquímico/enzimático para proteínas
• Síntese química de moléculas orgânicas
• Varredura de proteína em painel de moléculas
• Derivação de células-tronco
PUBLICAÇÕES
- Fanti, R. C., Vasconcelos, S. N. S., Catta-Preta, C. M. C., Sullivan, J. R., Riboldi, G. P., dos Reis, C. v., Ramos, P. Z., Edwards, A. M., Behr, M. A., & Couñago, R. M. (2022). A Target Engagement Assay to Assess Uptake, Potency, and Retention of Antibiotics in Living Bacteria. ACS Infectious Diseases. https://doi.org/10.1021/acsinfecdis.2c00073
- Lins, É. M., Oliveira, N. C. M., Reis, O., Ferrasa, A., Herai, R., Muotri, A. R., Massirer, K. B., & Bengtson, M. H. (2022). Genome-wide translation control analysis of developing human neurons. Molecular Brain, 15(1), 55. https://doi.org/10.1186/s13041-022-00940-9
- Wu, Qin, David Y. Nie, Wail Ba-alawi, YiShuai Ji, ZiWen Zhang, Jennifer Cruickshank, Jillian Haight, et al. 2022. “PRMT Inhibition Induces a Viral Mimicry Response in Triple-Negative Breast Cancer.” Nature Chemical Biology, May. https://doi.org/10.1038/s41589-022-01024-4.
- Segretti, Natanael D., Jéssica E. Takarada, Marcos A. Ferreira, André da Silva Santiago, Bruno V.M. Teodoro, Mariana C.F.C.B. Damião, Paulo H. Godoi, et al. 2022. “Discovery of Novel Benzothiophene Derivatives as Potent and Narrow Spectrum Inhibitors of DYRK1A and DYRK1B.” Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 68 (July): 128764. https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2022.128764.
- Papes, Fabio, Antonio P. Camargo, Janaina S. de Souza, Vinicius M. A. Carvalho, Ryan A. Szeto, Erin LaMontagne, José R. Teixeira, et al. 2022. “Transcription Factor 4 Loss-of-Function Is Associated with Deficits in Progenitor Proliferation and Cortical Neuron Content.” Nature Communications 13 (1): 2387. https://doi.org/10.1038/s41467-022-29942-w.
- Ricardo, Ricardo A., André da Silva Santiago, Martin P. Schwalm, Zexi Hu, Caio v. dos Reis, Jessica E. Takarada, Priscila Mezzomo, et al. 2022. “Development of the First Covalent Monopolar Spindle Kinase 1 (MPS1/TTK) Inhibitor.” Journal of Medicinal Chemistry 65 (4). https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.1c01165.
- Scott, Fiona, Angela M. Fala, Jessica E. Takarada, Mihaela P. Ficu, Lewis E. Pennicott, Tristan D. Reuillon, Rafael M. Couñago, Katlin B. Massirer, Jonathan M. Elkins, and Simon E. Ward. 2022. “Development of Dihydropyrrolopyridinone-Based PKN2/PRK2 Chemical Tools to Enable Drug Discovery.” Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters 60. https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2022.128588.
- Eduful, Benjamin J., Sean N. O’Byrne, Louisa Temme, Christopher R. M. Asquith, Yi Liang, Alfredo Picado, Joseph R. Pilotte, et al. 2021. “Hinge Binder Scaffold Hopping Identifies Potent Calcium/Calmodulin-Dependent Protein Kinase Kinase 2 (CAMKK2) Inhibitor Chemotypes.” Journal of Medicinal Chemistry 64 (15): 10849–77. https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.0c02274.
- Ferreira, Tiago R., Rafael M. Couñago, and Nilmar S. Moretti. 2021. “Raising the Bar(-Seq) in Leishmania Genetic Screens.” Trends in Parasitology 37 (5): 367–69. https://doi.org/10.1016/j.pt.2021.03.002.
- Cabarca, Sindy, Maximilia Frazão de Souza, Andrew Albert de Oliveira, Gabriel S. Vignoli Muniz, M. Teresa Lamy, Caio Vinicius dos Reis, Jessica Takarada, et al. 2021. “Structure of the Mycobacterium Tuberculosis CPknF and Conformational Changes Induced in Forkhead-Associated Regulatory Domains.” Current Research in Structural Biology 3: 165–78. https://doi.org/10.1016/j.crstbi.2021.07.001.
CONTATO
Dra. Katlin Brauer Massirer
Pesquisadora
Email: kmassire@unicamp.br
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